Jurnal Internasional RNA-Seq sel tunggal limfoma folikel mengungkapkan tipe sel B ganas dan koekspresi dari pos pemeriksaan imun sel-T

Download Jurnal Disini

Poin-Poin Utama

  • Sel limfoma folikular ganas segregate menjadi beberapa subclone yang hidup berdampingan, ditandai dengan aktivitas jalur diferensial.

  • Dalam CD4 + Treg, gen yang dikenal dengan pos pemeriksaan kekebalan dikekresi dengan faktor transkripsi dan kekebalan. regulator, termasuk CEBPA dan B2M.

Abstrak Abstrak

Abstrak

Limfoma Follicular (FL) adalah sel B bermutu rendah keganasan yang berubah menjadi penyakit yang sangat agresif dan mematikan pada tingkat 2% per tahun. Isolasi sempurna populasi sel B ganas dari biopsi bedah merupakan tantangan yang signifikan, menutupi biologi FL yang penting, seperti pola koekspresi pos pemeriksaan imun. Untuk menyelesaikan jaringan transkripsional yang mendasari limfoma sel-B folikel, kami menganalisis transkripom dari 34.818 sel yang berasal dari 6 tumor FL primer. Untuk setiap tumor, kami mengidentifikasi subpopulasi imun normal dan sel B ganas, berdasarkan pada ekspresi gen. Kami menggunakan analisis aliran berbagai warna dari tumor yang sama untuk mengkonfirmasi penugasan kami tentang garis keturunan seluler dan memvalidasi prediksi kami tentang protein yang diekspresikan. Perbandingan ekspresi gen antara sel-sel B ganas dan normal yang cocok dari pasien yang sama mengungkapkan fitur spesifik tumor. Sel-sel B ganas menunjukkan ekspresi rantai cahaya imunoglobulin (Ig) terbatas (baik Igκ atau Igλ), serta upregulasi gen BCL2 yang diharapkan, tetapi juga downregulasi FCER2] CD52dan gen kelas II kompleks histokompatibilitas utama. Dengan menganalisis ribuan sel individu per tumor pasien, kami mengidentifikasi mosaik subklon sel B ganas yang hidup berdampingan dalam FL dan memeriksa karakteristik sel T yang menginfiltrasi tumor. Kami mengidentifikasi gen yang hidup berdampingan dengan molekul pos pemeriksaan imun, seperti CEBPA dan B2M dalam sel T (Treg) regulator, memberikan pemahaman yang lebih baik tentang jaringan gen yang terlibat dalam regulasi imun. Ringkasnya, pengukuran paralel ekspresi sel tunggal dalam ribuan sel tumor dan limfosit yang menginfiltrasi tumor dapat digunakan untuk memperoleh pandangan tingkat sistem dari lingkungan mikro tumor dan mengidentifikasi jalan baru untuk pengembangan terapi.

  • Diserahkan [1945] 31, 2018.
  • Diterima 11 Desember 2018.

Download Jurnal Disini

Tags: