Jurnal Internasional Penemuan genom yang luas dari pengkodean somatik dan nonkoding mutasi pada limfoma Burkitt endemik dan sporadis

Download Jurnal Disini

Meskipun umumnya dapat disembuhkan dengan kemoterapi intensif di rangkaian kaya sumber daya, limfoma Burkitt (BL) tetap merupakan penyakit mematikan pada pasien yang lebih tua dan di Afrika sub-Sahara. Positif Epstein-Barr virus (EBV) adalah fitur di lebih dari 90% kasus di daerah endemis malaria, dan hingga 30% di tempat lain. Namun, fitur molekuler BL belum dievaluasi secara komprehensif ketika mempertimbangkan status tumor EBV atau asal geografis. Melalui analisis integratif seluruh genom dan data transkriptome, kami menunjukkan peningkatan luas genom yang mencolok pada hipermutasi somatik yang menyimpang pada tumor EBV-positif, mendukung hubungan antara EBV dan aktivitas yang diinduksi aktivasi cytidine deaminase (AICDA). Selain mengidentifikasi kandidat gen BL baru seperti SIN3AUSP7dan CHD8kami menunjukkan bahwa tumor positif EBV memiliki lebih sedikit mutasi driver secara signifikan, terutama di antara gen dengan peran dalam apoptosis. Kami juga menemukan gen wilayah variabel imunoglobulin yang secara tidak proporsional digunakan untuk menyandikan reseptor sel B klon (BCR) dalam tumor. Ini termasuk IGHV4-34, diketahui memproduksi antibodi autoreaktif, dan IGKV3-20, fitur yang dijelaskan dalam keganasan sel B lainnya tetapi belum pada BL. Hasil kami menunjukkan bahwa status EBV tumor menentukan fenotipe BL spesifik terlepas dari asal geografis, dengan sifat molekuler tertentu dan mekanisme patogenik yang berbeda. Pola mutasi baru yang diidentifikasi di sini menyiratkan penggunaan rasional kemoterapi yang merusak DNA pada beberapa pasien dengan BL dan agen yang ditargetkan seperti CDK4 / 6 inhibitor palbociclib pada orang lain, sedangkan pentingnya pensinyalan BCR pada BL memperkuat potensi manfaat inhibitor PI3K, Syk, dan Src keluarga kinase di antara pasien ini.

Download Jurnal Disini

Tags: