Jurnal Internasional Memahami peran variabilitas genetik di LRRK2 di populasi India – Kishore – – Gerakan Gangguan

Download Jurnal Disini

Latar Belakang

Variabilitas genetik dalam LRRK2 telah benar-benar ditetapkan sebagai faktor risiko utama untuk bentuk-bentuk PD keluarga dan sporadis dalam populasi etnis yang beragam.
            

Tujuan

Untuk menyelesaikan peran LRRK2 dalam populasi India.
            

Metode

Kami melakukan resequencing yang ditargetkan dari LRRK2 lokus dalam 288 kasus dan 298 kontrol dan menyelesaikan struktur haplotypic LRRK2 dalam kohort gabungan 800 kasus dan 402 kontrol dalam populasi India. Kami menilai frekuensi varian missense baru pada populasi kulit putih dan Asia Timur dengan memanfaatkan sekuens eksome dan data genotip padat, masing-masing. Kami melakukan pemodelan komputasi dan pendekatan biokimia untuk menyimpulkan peran potensial varian baru yang mempengaruhi fungsi protein LRRK2. Akhirnya, kami menilai aktivitas fosforilasi varian pengkodean novel yang teridentifikasi dalam gen LRRK2.
            

Hasil

Kami mengidentifikasi empat varian baru missense dengan frekuensi mulai dari 0,0008% hingga 0,002% khusus untuk penduduk India, meliputi domain armadillo dan kinase protein LRRK2. Keragaman genetik umum dalam LRRK2 dapat berkontribusi terhadap peningkatan risiko, tetapi tidak signifikan setelah mengoreksi untuk beberapa pengujian, karena ukuran kohort yang kecil. Pemodelan komputasi menunjukkan efek destabilisasi pada fungsi LRRK2. Dibandingkan dengan wild-type, varian kinase domain menunjukkan peningkatan 4 kali lipat dalam aktivitas kinase.
            

Kesimpulan

Penelitian kami, untuk pertama kalinya, mengidentifikasi varian baru missense untuk LRRK2khusus untuk penduduk India, dan menunjukkan bahwa varian missense novel dalam domain kinase memodifikasi aktivitas kinase secara in vitro. . © 2018 International Parkinson dan Gerakan Disorder Society
            

Tags: