Jurnal Internasional Autoregulasi sementara selama pembentukan PU1 locus manusia SubTAD

Download Jurnal Disini

Kontrol epigenetik dari ekspresi gen terjadi dalam unit-unit kromosom spasial diskrit yang disebut topologi asosiasi domain (TAD), tetapi persyaratan spasial yang tepat dari sebagian besar gen tidak diketahui; ini minat khusus untuk gen yang terlibat dalam kanker. Oleh karena itu kami menerapkan pengacakan penyesuaian kromosomal resolusi tinggi untuk memetakan organisasi tiga dimensi (3D) dari lokus manusia yang mengkodekan faktor kunci transkripsi myeloid PU.1 dalam monosit sehat dan sel myeloid leukemia akut (AML). Kami mengidentifikasi unit ~ 75-kb dinamis (SubTAD) sebagai wilayah genom di mana interaksi spasial antara unsur-unsur regulator gen PU.1 terjadi selama diferensiasi myeloid dan terputus dalam AML. Dalam SubTAD ini, inisiasi interaksi spasial kromosom yang tepat membutuhkan autoregulasi PU.1 dan perekrutan protein kromatin-adaptor LDB1 (protein pengikat domain LIM 1). Namun, begitu interaksi spasial ini terjadi, LDB1 menstabilkan mereka secara independen dari autoregulasi PU.1. Dengan demikian, data kami mendukung bahwa PU.1 melakukan autoregulasi ekspresinya dengan cara “tabrak lari” dengan memulai loop kromosom stabil yang menghasilkan arsitektur kromatin transkripsi aktif.

Download Jurnal Disini

Tags: